CLASE
CLASE programa para [[Clasificaci�n num�rica]] escrito por Lcgarcia[1] , en 1976 en FORTRAN IV, con base en algoritmos y m�todos de Clifford y Stephenson, 1975. El programa ha sufrido (�literalmente!) varias modificaciones: en 1986 J. L. Jurado Monta�o incluy� �ndices de asociaci�n citados por Mateucci y Colma, 1982; en 1996 M�nica Toro migr� CLASE a 4thDimension�. (�Un cambio cada 10 a�os? Entonces este a�o deber�a hacerse un ajuste. �Cu�l?)
CLASE permite efectuar [[Clasificaci�n num�rica|clasificaciones]] aglomerativas, polit�ticas cualitativas (mediante el c�lculo de �ndices de similitud de Jaccard, Czekanowski, o apareamiento simple�) y cuantitativas (mediante el c�lculo de distancia euclidiana e �ndices de similitud de Bray-Curtis, Sokal y otros).
Los datos de entrada son una matriz de frecuencia o abundancia[2] que se puede convertir a presencia/ausencia, de n individuos por m atributos. Los datos pueden ser transformados y estandarizados en varias formas; puesto que los datos se leen de un banco de datos en 4thD, es posible trabajar con toda la matriz o un subconjunto de ella, mediante b�squedas estructuradas (polit�ticas) o utilizando criterios simples para inclusi�n/exclusi�n de determinados individuos o atributos. Se puede hacer una clasificaci�n cualitativa -con la matriz transformada a presencia/ausencia- o cuantitativa con la matriz original. Se pueden efectuar clasificaciones directas, i. e., agrupamiento de individuos por atributos comunes o inversas, agrupamiento de atributos que comparten los mismos individuos.
�ndices de diversidad y similitud
Con los listados de presencia - ausencia y abundancia de especies por localidad o fecha se calculan �ndices de diversidad, uniformidad, riqueza de Shannon-Weaver, Simpson, MacArthur, Fager mediante el programa Diver, independiente de CLASE.
Apostillas
- ^ CLASE se inici� en 1975, con Steve Godley, como un trabajo de clase de ecolog�a cuantitativa, un curso de postgrado del Dr. Steve Bloom en en USF. Se modific� un programa m�s simple (CLASS) elaborado por S. Bloom para permitir reducciones del conjunto de datos (tanto individuos como atributos) e incluir algunos �ndices de afinidad faun�stica (Simpson y otros) empleados por Dr. Roy McDiarmid en sus an�lisis de herpetofauna de la costa pac�fica de M�xico (�fecha?). CLASE fue ensayado con una matriz tomada de McDiarmid (elaborada por �l) que era cualitativa (presencia/ausencia) y se reemplaz� por una matriz de abundancia, inferida �sta por la frecuencia de una sp dada en las colecciones herpetol�gicas (USNM, USC, sistema UC, Stanford, Penn, Harvard, Yale, etc., etc.) cuyos cat�logos estaban publicados (realmente McDiarmid prepar� tambi�n esta 2a matriz). Se tomaron 20+ sitios cada uno 15' de grado de anchura a lo largo del gradiente latitudinal N - S desde el nivel del mar hasta la divisoria continental, con algunas excepciones. El an�lisis permiti� refinar hallazgos de McDiarmid y mejor� interpretaci�n ecol�gica de agrupamientos. En el simposio de herpetolog�a de 1975 se present� una versi�n preliminar del an�lisis hecho con CLASE. Tanto el manuscrito como el librito de memorias est�n perdidos; subsisten si los decks (mazos) de tarjetas Hollerith del programa y de la base de datos. Con base en estos se reconstruy� CLASE como se indic� arriba. (Ing. Jorge Ram�n de UIS, entonces estudiante de postgrado en UofM, optimiz� CLASE en unas vacaciones en USF; a�n as�, el programa ten�a un tama�o de 186 kB, el conjunto de datos 148 kB y por tanto se requer�a autorizaci�n para correrlo en el centro de c�mputo de USF; la administradora del CC prefer�a que se hiciera en horario nocturno para evitar congestiones. �C�mo han cambiado las cosas!)
- ^ Se pueden utilizar datos directos o indirectos (derivados de una correlaci�n o extrapolaci�n).
[[Categor�a:Glosario]] [[Categor�a:Metodolog�a]] [[Categor�a:Acr�nimo]] [[Categor�a:Esbozo]]